Add common c-utils, make flatdb aligned on disk
[tedtools.git] / tests / flatdb
1 [ -f temp/FLAT ] && rm -rf temp/FLAT 
2 ./flatdbtest -f temp/FLAT -p ariz -p ddk29f -p s -p a99t -p suf8eee -p z0kv -p lw2 -p twv4 -p 8co6 -p u2nie4xqc -p qgw -p cnpebn -p mmlkvhe6ox -p qite -p nqzpq8aqj -p ill7niztn -p khpq87qew -p q -p wz -p wgrmy -p 8ch2icos -p v4xc -p ljklkyz5ud -p 72jzxf -p r4ysgda -p 9r -p x -p 7o8gh -p yi -p oxr8qbhgwl -p y4zkee -p yjin -p ycblv -p q -p nlbzzooco -p 1flp -p xphng -p avjrii116x -p fyuxgehv4 -p ia || exit 1
3
4 ./flatdbtest -r -f temp/FLAT -g 16 -g 24 -g 36 -g 44 -g 52 -g 64 -g 72 -g 80 -g 88 -g 96 -g 112 -g 120 -g 132 -g 148 -g 156 -g 172 -g 188 -g 204 -g 212 -g 220 -g 232 -g 244 -g 252 -g 268 -g 280 -g 292 -g 300 -g 308 -g 320 -g 328 -g 344 -g 356 -g 364 -g 376 -g 384 -g 400 -g 408 -g 420 -g 436 -g 452 || exit 1
5
6 ./flatdbtest -f temp/FLAT -d 16 -d 24 -d 36 -d 308 -d 52 -d 212 || exit 1
7
8 ./flatdbtest -f temp/FLAT -v || exit 1 
9
10 ./flatdbtest -r -f temp/FLAT -g 36 -g 44 -g 64 -g 72 -g 80 -g 88 -g 96 -g 112 -g 120 -g 132 -g 148 -g 156 -g 172 -g 188 -g 204 -g 220 -g 232 -g 244 -g 252 -g 268 -g 280 -g 292 -g 300 -g 320 -g 328 -g 344 -g 356 -g 364 -g 376 -g 384 -g 400 -g 408 -g 420 -g 436 -g 452 || exit 1
11
12 ./flatdbtest -f temp/FLAT -s || exit 1
13
14